Hiện tỉnh Hưng Yên đã xây dựng được 3 khu công nghiệp có hệ thống nước thải tập trung. Tuy nhiên, vẫn còn một số doanh nghiệp trên địa bàn chưa hoàn thiện các thủ tục về môi trường. Đây chính là nguyên nhân khiến các dòng sông quanh các nhà máy ở Hưng Yên thường xuyên đen kịt, bốc mùi hôi thối khó chịu. Những hành vi vi phạm môi trường như thế này chưa được các lực lượng chức năng và chính quyền các địa phương mà hệ thống thủy lợi Bắc Hưng Hải đi qua xử lý. Nếu tình trạng này không được xử lý thì hệ thống thủy lợi Bắc Hưng Hải trong tương lai gần sẽ trở thành dòng sông chết.
