Trung tâm Kiểm soát bệnh tật TP HCM thành lập từ 7 đơn vị gồm Trung tâm Y tế dự phòng, Trung tâm Truyền thông giáo dục sức khỏe, Trung tâm Dinh dưỡng, Trung tâm Phòng chống HIV/AIDS, Trung tâm Chăm sóc sức khỏe sinh sản, Trung tâm Bảo vệ sức khỏe lao động và Môi trường, Trung tâm Kiểm dịch y tế quốc tế. Tháng 1/2020 sáp nhập tiếp Trung tâm Kiểm dịch y tế quốc tế.
