Nếu ở các quận nội thành TP. Hồ Chí Minh, rác thải, nước thải đổ xuống kênh rạch phần lớn là do làm nhà lấn chiếm dòng chảy và ý thức người dân, thì ở huyện Bình Chánh - nơi cuối nguồn, ngoài rác còn có nước thải công nghiệp không qua xử lý xả trực tiếp ra môi trường. Điều này khiến phần lớn kênh rạch bị ô nhiễm nặng nề.
